生物样本库BS小组
摘要
福尔马林固定石蜡包埋的组织样本（Formalin-fixed，paraffin-embedded，FFPE），是一种有潜在临床研究价值的样本来源。因为一旦这些临床FFPE被存入医院档案，就可以在短时间内收集相应的临床资料，所以在研究蛋白质生物标记物时，FFPE能够引起研究者的兴趣。尽管在文献中有越来越多的有关FFPE蛋白组学的研究，但仍然缺少标准操作规程。从FFPE获得有效的、完整长度的、可重复的蛋白质，在标准操作规程的发展中具有研究的挑战性。
在本研究中，用八种蛋白质提取缓冲液，经(SDS-PAGE)单相蛋白电泳结合液相色谱串联质谱方法(GeLC-MS/MS)，进行蛋白质提取效率的严格比较。研究这些提取缓冲液导致的数据差异，是因为在FFPE作为蛋白生物标记物检测时，要注意到差异结果是可能来源于试剂和方法的选择。另外，用FFPE和新鲜冻存的组织，进行蛋白提取率和可重复性的定性比较。
作者：Vale´rie Broeckx，et al.【University of Leuven, Belgium】
编译：张筱静【南通大学医学院】
校审：黄剑飞【南通大学附属医院】
原文：【15107】
Comparison of multipleprotein extraction buffers for GeLC-MS/MS proteomic analysis of liver and colonformalin-fixed paraffin-embedded tissues. Mol Biosyst. 2016 Jan26;12(2):553-65. doi: 10.1039/c5mb00670h.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26676081
